В некоторых случаях ИП, использующий труд наемных работников при ведении и ПСН-деятельности, и деятельности, переведенной на упрощенку, платит НДФЛ с зарплаты персонала в разные инспекции.
Дело в том, что ИП на УСН всегда уплачивает агентский НДФЛ по месту своего жительства. А вот для патентников правила немного другие – они уплачивают НДФЛ с выплат свои работникам по месту учета в качестве плательщика ПСН.
Соответственно, если ИП получал патент в своей «домашней» инспекции, то агентский НДФЛ с зарплаты всех своих работников он уплачивает по месту своего жительства. А вот если в качестве патентника предприниматель зарегистрирован в ИФНС в другом регионе, налог с выплат «патентным» работникам он должен уплачивать именно туда.
Источник: Письмо Минфина от 07.12.2021 № 03-04-05/99172