Если работник трудится в обособленном подразделении, то НДФЛ с его доходов нужно уплачивать по месту нахождения этого подразделения. Об этом напомнил Минфин России в письме от 08.07.19 № 03-04-06/50319.
Авторы письма напоминают положения пункта 7 статьи 226 Налогового кодекса. В этом пункте сказано, что налоговые агенты — российские организации обязаны перечислять исчисленные и удержанные суммы НДФЛ в бюджет как по месту своего нахождения, так и по месту нахождения каждого своего обособленного подразделения. При этом сумма налога, которую нужно заплатить по месту нахождения обособленного подразделения, определяется исходя из доходов, выплаченных работникам этого подразделения.
Соответственно, налог с доходов работника обособленного подразделения необходимо перечислять в бюджет по месту постановки на учет организации по месту нахождения обособленного подразделения. Если сотрудник не является работником обособленного подразделения организации, то совокупная сумма удержанного налога уплачивается в бюджет по месту учета головной организации.