Компании, которые уведомили ИФНС о переходе на централизованно представление 6-НДФЛ и 2-НДФЛ с 2020 года, НДФЛ-отчетность по итогам 2019 года должны сдавать отдельно по головному офису и ОП.
Источник: Письмо ФНС от 14.05.2020 # БС-4-11/7971@
Дело в том, что норма, благодаря которой организации, имеющие ОП, получили возможность представлять НДФЛ-отчетность централизованно, действует с 01.01.2020. Соответственно, при представлении отчетности по итогам 2019 года новый порядок не применяется. Т.е. 6-НДФЛ и 2-НДФЛ за 2019 год нужно сдать отдельно по компании и каждой обособке.
И учтите, что если вы собираетесь перейти на централизованную сдачу НДФЛ-отчетности с 2021 года, такой порядок не будет действовать для отчетности за 2020 год.
Напомним, что крайний срок представления 6-НДФЛ за 2019 год перенесен на 01.06.2020.