Право на получение налоговых вычетов по НДФЛ имеют налогоплательщики, получающие доходы, относящиеся к основной налоговой базе и облагаемые НДФЛ по ставке 13%, в том числе и индивидуальные предприниматели.
Вместе с тем в рамках специальных налоговых режимов налоговая нагрузка для физических лиц существенно ниже, чем в соответствии с общим режимом налогообложения.
При этом регионы и органы местного самоуправления имеют широкие полномочия по регулированию налоговой нагрузки по указанным специальным налоговым режимам.
Соответственно, к доходам индивидуального предпринимателя от видов деятельности, по которым он платит не НДФЛ, а иной налог в связи с применением специального налогового режима, налоговые вычеты по НДФЛ не применяются разъясняет Минфин в письме от 27.08.2021 № 03-04-05/69314.