Если продавец выставил счет-фактуру в одном квартале, а покупатель получил его следующем, вычет налога можно заявить только после получения этого документа. Письмо Минфина России от 16 апреля 2019 года № 03-07-09/27004.
По общему правилу покупатель может принять к вычету НДС, уплаченный при перечислении аванса продавцу (п. 9 ст. 172 НК РФ). Документ, на основании которого можно заявить вычет налога– счет-фактура, выданный продавцом, получившим предоплату от покупателя.
Кроме того, покупатель должен иметь договор, в котором предусмотрена возможность перечисления аванса, и платежные документы, подтверждающие его уплату.
По мению Минфина, если продавец выставил авансовый счет-фактуру в одном квартале, а покупатель получил его в следующем, то заявить НДС к вычету можно только в периоде, когда счет-фактура получен покупателем. А период его выставления роли не играет.